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Nous nous proposons cette année d'examiner en profondeur les avancées
récentes en biologie synthetique. Cette discipline en pleine
effervescence se definit comme une nouvelle forme d'ingenierie dont
la caracteristique est de trouver ses composants de base et ses
methodes de conception dans le domaine du vivant. Les buts affichés
sont très divers. Il peut aussi bien s'agir de simplifier,
d'améliorer, de mieux observer et contrôler les systèmes vivants
existants, que de produire de nouveaux systèmes. De récentes percées
dans la biochimie de l'ADN et d'autres bio-polymeres fondamentaux
permettent aujourd'hui de considerer la modification ou la synthèse
de novo de voies de signalisations, d'organismes ou même
d'ecosystèmes tout entiers. Du point de vue computationnel le passage
de la modelisation des systèmes existants [biologie systemique] a
celle de systèmes synthetiques a une consequence importante: il
devient possible de concevoir les composants et les conditions dans
lesquelles ils operent de sorte que les techniques de modelisation
usuelles -qui n'ont souvent qu'une portee qualitative- deviennent
predictives. Il y a donc une réelle opportunite pour une conception
in silico efficace. Le fil conducteur du cours sera donc de dresser
la carte des differents espaces de composants ou media biologiques
considerés jusque là, de mentionner les réalisations marquantes, et
de s'attarder tout particulierement sur les perspectives de
modelisation offertes.
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